Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Reep3Q99KK1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Reep3Q99KK1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms