Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp11Q99K46 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp11Q99K46 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms