Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TrabdQ99JY4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TrabdQ99JY4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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TrabdQ99JY4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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TrabdQ99JY4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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TrabdQ99JY4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TrabdQ99JY4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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TrabdQ99JY4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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TrabdQ99JY4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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TrabdQ99JY4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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