Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GatbQ99JT1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GatbQ99JT1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms