Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pacsin3Q99JB8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms