Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxp3Q99JB6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxp3Q99JB6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms