Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddb2Q99J79 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms