Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms