Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Smim11aQ99J19 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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