Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Cldn16Q925N4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Cldn16Q925N4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Cldn16Q925N4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Cldn16Q925N4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Cldn16Q925N4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn16Q925N4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Cldn16Q925N4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Cldn16Q925N4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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