Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms