Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atpaf2Q91YY4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms