Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sec16bQ91XT4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms