Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Creb3l3Q91XE9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Creb3l3Q91XE9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms