Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd3Q91W18 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms