Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms