Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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