Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VDP2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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