Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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