Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med17Q8VCD5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms