Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc12Q8R344 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms