Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1N4

Nudcd3, NudC domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd3Q8R1N4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nudcd3Q8R1N4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms