Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hoxc12Q8K5B8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hoxc12Q8K5B8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hoxc12Q8K5B8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hoxc12Q8K5B8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hoxc12Q8K5B8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hoxc12Q8K5B8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hoxc12Q8K5B8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hoxc12Q8K5B8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hoxc12Q8K5B8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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