Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hecw1Q8K4P8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms