Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MyripQ8K3I4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms