Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vrk3Q8K3G5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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