Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssh3Q8K330 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms