Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl47Q8K2Y7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl47Q8K2Y7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms