Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbm48Q8K2X2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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