Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gtf3c1Q8K284 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gtf3c1Q8K284 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c1Q8K284 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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