Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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