Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Cldn34c1Q8K193 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Cldn34c1Q8K193 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Cldn34c1Q8K193 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Cldn34c1Q8K193 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Cldn34c1Q8K193 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Cldn34c1Q8K193 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Cldn34c1Q8K193 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Cldn34c1Q8K193 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Cldn34c1Q8K193 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Cldn34c1Q8K193 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Cldn34c1Q8K193 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Cldn34c1Q8K193 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cldn34c1Q8K193 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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