Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms