Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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FgbQ8K0E8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FgbQ8K0E8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FgbQ8K0E8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FgbQ8K0E8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FgbQ8K0E8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FgbQ8K0E8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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FgbQ8K0E8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FgbQ8K0E8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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FgbQ8K0E8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms