Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms