Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Znf628Q8CJ78 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Znf628Q8CJ78 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Znf628Q8CJ78 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Znf628Q8CJ78 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Znf628Q8CJ78 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Znf628Q8CJ78 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Znf628Q8CJ78 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Znf628Q8CJ78 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Znf628Q8CJ78 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf628Q8CJ78 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Znf628Q8CJ78 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms