Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms