Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CopaQ8CIE6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms