Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms