Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Arhgap29Q8CGF1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Arhgap29Q8CGF1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Arhgap29Q8CGF1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Arhgap29Q8CGF1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Arhgap29Q8CGF1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Arhgap29Q8CGF1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Arhgap29Q8CGF1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Arhgap29Q8CGF1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms