Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hpf1Q8CFE2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hpf1Q8CFE2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hpf1Q8CFE2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hpf1Q8CFE2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hpf1Q8CFE2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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