Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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