Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc28aQ8CEI3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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