Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam228aQ8CDW1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam228aQ8CDW1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms