Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms