Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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