Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slfn5Q8CBA2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms