Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Fbxo48Q8CAT8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Fbxo48Q8CAT8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Fbxo48Q8CAT8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fbxo48Q8CAT8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fbxo48Q8CAT8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Fbxo48Q8CAT8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo48Q8CAT8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms