Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dclre1bQ8C7W7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Dclre1bQ8C7W7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Dclre1bQ8C7W7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Dclre1bQ8C7W7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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