Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdac7Q8C2B3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Hdac7Q8C2B3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Hdac7Q8C2B3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hdac7Q8C2B3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Hdac7Q8C2B3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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